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AI/의료 데이터 분석

MIMIC-3란?

최말짱 2023. 1. 16. 14:20
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설명

  • MIMIC-III의 약자 = Medical Information Mart for Intensive Care III
  • Beth Israel Deaconess Medical Center 중환자실에서 발생한 데이터를 MIT에서 정리하고 개발
  • 2001년부터 2012년까지 약 4만 명 이상의 비식별 보건의료 데이터를 포함
    • 중환자실에 머물렀던(ICU Stays, Intensive Care Unit Stays) 총 61,532명의 환자
      • 성인 53,432명 + 영아 8,100명
    • 인구통계학(demographics), 활력 징후(vital sign), 실험실 결과, 처방전, 간병인 메모, 이미지 기록, 사망 여부 등의 데이터를 포함

다운로드 방법(승인 절차를 거쳐야 함)

https://www.notion.so/2-2-ad9d27f8044a46a4af2a9bf4754511cd

 

2.2 - 데이터 접근 권한 얻기

MIMIC-III 데이터는 이 책에서 패혈증 분석을 위해 전반적으로 사용하는 데이터이다. 공식 웹사이트는 https://mimic.physionet.org/ 이다.

www.notion.so

인턴일지🥕 MIMIC-III 0. 데이터 권한 얻기 ( Using Clinical Notes with Time Series Data for ICU Mana

 

인턴일지🥕 MIMIC-III 0. 데이터 권한 얻기 ( Using Clinical Notes with Time Series Data for ICU Mana

인턴을 지원했고 교수님이 연구 시작 전 세미 과제처럼 내주신 논문을 직접 실행해보기로 했다. arxiv.org/pdf/1909.09702.pdf 교수님이 논문과 코드를 함께 보내주셨다. 무작정 코드를 따라해 보려하는

kagus2.tistory.com

관련자료

MIMIC-III Clinical Database

 

MIMIC-III Clinical Database v1.4

 

physionet.org

미국 중환자실 데이터 MIMIC-III 정리

 

미국 중환자실 데이터 MIMIC-III 정리

해당 글은 https://mimic.physionet.org/about/mimic/를 참고하여 정리한 노트입니다.

baeseongsu.github.io

 

 

 

 

 

 

 

 

MIMIC-III 스키마 보기 

https://mit-lcp.github.io/mimic-schema-spy/

 

SchemaSpy - mimic.mimiciii

Comments Table Children Parents Columns Rows admissions 18 1 19 58,976 callout 2 24 34,499 caregivers 7 4 7,567 chartevents 5 15 330,712,483 chartevents_1 15 38,033,561 chartevents_10 15 9,584,888 chartevents_11 15 470,141 chartevents_12 15 265,413 chartev

mit-lcp.github.io

 

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